今後配信予定のダウンロードコンテンツへの対応、各種データ調整との事です。
おそらく、目に見えた変化はエナジードラッグMAXが無料で手に入らなくなった事でしょう。
邪道だからいいやと躊躇いなくアップデートしましたが、正攻法でT・C・Sの改修費用を捻出するのが大変です。

他、アンロックキー壱五を入手して周回プレイすると手に入れられなくなる不具合があるそうですが、改善されたんじゃないでしょうか。 
私には無縁なので確認してません。(何)